iPhone iOS:ään sisältyvien ja App Storesta hankkimiesi ohjelmien lisäksi organisaatiosi saattaa edellyttää joidenkin muiden ohjelmien asentamista. Sinulle saatetaan antaa valmiiksi maksettu lunastuskoodi App Storeen. Kun lataat ohjelman lunastuskoodilla, sinä omistat sen, vaikka koodi ostettiin puolestasi.
Organisaatio voi myös ostaa App Store -ohjelmalisenssejä ja antaa niitä sinulle määräajaksi, mutta säilyttää niiden omistusoikeuden. Näihin ohjelmiin pääsyä varten sinut kutsutaan osallistumaan organisaatiosi lisensointiohjelmaan. Kun olet rekisteröitynyt iTunes-tililläsi, sinua kehotetaan asentamaan sinulle osoitetut ohjelmat. Ne löytyvät myös App Storen Ostetut-luettelosta. Tällä tavalla saatu ohjelma poistetaan, jos organisaatio osoittaa sen jollekulle muulle.
Organisaatio saattaa myös kehittää omia ohjelmia, jotka eivät ei ole App Storessa. Ne asennetaan verkkosivulta tai, jos organisaatio käyttää mobiililaitteiden hallintajärjestelmää, saat ilmoituksen, joka kehottaa asentamaan ne langattomasti. Nämä ohjelmat kuuluvat organisaatiolle, ja ne saatetaan poistaa tai ne saattavat lakata toimimasta, jos poistat asetusprofiilin tai jos poistat iPhonen rekisteröinnin mobiililaitteiden hallintapalvelimesta.