Vaše organizace po vás může požadovat instalaci dalších aplikací doplňujících vestavěné aplikace a aplikace, které jste si stáhli z App Storu. Je možné, že vám bude poskytnut předplacený stahovací kód pro App Store. Když pomocí tohoto kódu stáhnete aplikaci, stane se vaším vlastnictvím, i když ji vaše organizace zaplatila za vás.
Vaše organizace také může zakoupit licence na aplikace z App Storu, které vám na určitý čas poskytne, ale zachová si jejich vlastnictví. Přístup k těmto aplikacím získáte prostřednictvím pozvánky do programu vaší organizace. Poté, co se zaregistrujete prostřednictvím svého účtu na iTunes, budete průběžně vyzýváni k instalaci aplikací, které vám budou přiřazeny. Také je uvidíte ve vašem seznamu Purchased v App Storu. Aplikace, které získáte tímto způsobem, budou odstraněny, pokud je organizace přiřadí někomu jinému.
Vaše organizace může rovněž vyvinout vlastní aplikace, které nejsou k dispozici v App Storu. Můžete je nainstalovat z webové stránky nebo prostřednictvím oznámení s žádostí o jejich bezdrátovou instalaci, které obdržíte, pokud vaše organizace používá správu mobilních zařízení. Tyto aplikace náleží vaší organizaci a v případě, že smažete konfigurační profil nebo ukončíte komunikaci iPhonu se serverem správy mobilních zařízení, je možné, že budou odstraněny nebo přestanou fungovat.