Εκτός από τις ενσωματωμένες εφαρμογές και αυτές που λαμβάνετε από το App Store, ο οργανισμός σας μπορεί να θέλει να προσθέσετε και κάποιες άλλες εφαρμογές. Μπορεί να σας δώσουν έναν προπληρωμένο κωδικό εξαργύρωσης για το App Store. Κατά τη λήψη εφαρμογής με χρήση κωδικού εξαργύρωσης, ο κωδικός αυτός σας ανήκει παρόλο που τον αγόρασε ο οργανισμός σας για εσάς.
Ο οργανισμός μπορεί επίσης να αγοράσει άδειες χρήσης εφαρμογών App Store τις οποίες θα σας εκχωρήσουν για συγκεκριμένη χρονική περίοδο, αλλά η κατοχή παραμένει δική τους. Θα λάβετε πρόσκληση για συμμετοχή στο πρόγραμμα του οργανισμού σας για να αποκτήσετε πρόσβαση σε αυτές τις εφαρμογές. Μετά την εγγραφή σας στο πρόγραμμα με τον λογαριασμό iTunes, θα σας ζητηθεί να εγκαταστήσετε αυτές τις εφαρμογές αφού πρώτα εκχωρηθούν σε εσάς. Μπορείτε επίσης να τις βρείτε στη λίστα «Αγορασμένα» σας στο App Store. Μια εφαρμογή που λαμβάνετε με αυτόν τον τρόπο αφαιρείται αν ο οργανισμός την εκχωρήσει σε άλλο άτομο.
Ο οργανισμός σας μπορεί επίσης να δημιουργήσει προσαρμοσμένες εφαρμογές που δεν βρίσκονται στο App Store. Θα τις εγκαταστήσετε από μια ιστοσελίδα ή, αν ο οργανισμός σας χρησιμοποιεί διαχείριση φορητών συσκευών, θα λάβετε μια γνωστοποίηση που θα σας ζητά να τις εγκαταστήσετε μέσω ασύρματου δικτύου. Αυτές οι εφαρμογές ανήκουν στον οργανισμό σας και μπορεί να αφαιρεθούν ή να σταματήσουν να λειτουργούν αν διαγράψετε ένα προφίλ διαμόρφωσης ή αποσυσχετίσετε το iPhone από τον διακομιστή διαχείρισης φορητών συσκευών.