Oltre alle app integrate e quelle che puoi scaricare da App Store, la tua organizzazione potrebbe richiedere l'uso di altre app. Potrebbe quindi fornirti un codice di riscatto prepagato da utilizzare su App Store. Quando scarichi un'app utilizzando un codice di riscatto, diventa tua, anche se è stata acquistata dalla tua organizzazione.
La tua organizzazione può anche acquistare delle licenze per app di App Store che ti vengono assegnate per un certo periodo di tempo, ma che poi l'organizzazione ritirerà. Per accedere a queste app ti sarà chiesto di partecipare al programma della tua organizzazione. Quando ti registri con il tuo account iTunes, ti verrà chiesto di installare le app quando ti vengono assegnate. Puoi trovarle anche nell'elenco Acquistate in App Store. Le app che ricevi in tale modo vengono rimosse se l'organizzazione le assegna a un'altra persona.
La tua organizzazione può anche sviluppare app personalizzate che non sono presenti in App Store. Dovrai installarle da una pagina web oppure, se la tua organizzazione utilizza la gestione dei dispositivi mobili, riceverai una notifica chiedendoti di installarle via etere (over the air). Queste app appartengono alla tua organizzazione e potrebbero essere rimosse o smettere di funzionare se elimini un profilo di configurazione, oppure se dissoci iPhone dal server per la gestione dei dispositivi mobili.