Det kan hende at bedriften vil at du skal ha enkelte andre programmer i tillegg til innebygde programmer og de du laster ned fra App Store. De kan gi deg en forhåndsbetalt innløsningskode for App Store. Når du laster ned et program ved hjelp av en innløsningskode, eier du programmet selv om bedriften har betalt for det.
Bedriften kan også kjøpe App Store-programlisenser som de tilordner deg for en periode, men som bedriften beholder. Du blir invitert til å delta i bedriftens program for å få tilgang til disse programmene. Når du har registrert deg med iTunes-kontoen din, blir du bedt om å installere programmene når du får dem tilordnet. Du finner dem også i Kjøpt-listen i App Store. Programmer du får på denne måten, blir fjernet hvis bedriften tilordner dem til noen andre.
Bedriften kan også utvikle tilpassede programmer som ikke finnes i App Store. Du installerer dem fra en nettside, eller du får beskjed om å installere dem trådløst hvis bedriften bruker Mobile Device Management. Disse programmene tilhører bedriften, og de kan fjernes eller slutte å virke hvis du sletter en konfigurasjonsprofil eller kobler iPhone fra tjeneren for Mobile Device Management.