iPhone Yerleşik uygulamalara ve App Store’dan edindiğiniz uygulamalara ek olarak şirketiniz belirli başka uygulamalara sahip olmanızı isteyebilir. Şirketiniz, size App Store için önceden ödenmiş bir kod sağlayabilir. Kodu kullanarak uygulamayı indirdiğinizde, uygulamayı sizin için satın alan şirketiniz olsa bile uygulamanın sahibi siz olursunuz.
Şirketiniz, size bir süreliğine atayıp ama şirketin elinde bulunduracağı App Store uygulama lisansları da satın alabilir. Bu uygulamalara erişebilmek için şirketinizin programına katılmaya davet edilirsiniz. iTunes hesabınızla kayıt olduktan sonra, bu uygulamalar size atandığında onları yüklemeniz istenir. Bu uygulamaları App Store’daki Satın Alınanlar listenizde de bulabilirsiniz. Bu şekilde edindiğiniz bir uygulama şirketiniz tarafından başka birisine atanırsa silinir.
Şirketiniz, App Store’da olmayan özel uygulamalar da geliştirebilir. Bu uygulamaları bir web sayfasından yüklersiniz veya şirketiniz taşınabilir aygıt yönetimini kullanıyorsa, uygulamaları kablosuz olarak yüklemenizi isteyen bir bildirim alırsınız. Bu uygulamalar şirketinize aittir; konfigürasyon profilini silerseniz veya iPhone ile taşınabilir aygıt yönetimi sunucusunun ilişkisini keserseniz silinebilir veya çalışmamaya başlayabilir.