iPhone 除了内建的应用程序以及从 App Store 下载的应用程序，您的机构可能想让您拥有特定的其他应用程序。他们可能向您提供 App Store 的预付兑换码。当您使用兑换码下载应用程序时，您即拥有这个应用程序，即使它是由您的机构为您购买的。
您的机构也可以购买 App Store 应用程序许可证以将应用程序分配给您使用一段时间，但是由机构保留这些许可证。您将被邀请参与机构的项目以访问这些应用程序。您使用 iTunes 帐户注册后，会提示您安装机构分配给您的这些应用程序。您也可以在 App Store 的“已购项目”列表中找到它们。如果机构将您以此方式接收的应用程序分配给其他人，则该应用程序会被移除。
您的机构也有可能开发自定应用程序，它们不在 App Store 中。您将从网页安装它们，或者，如果您的机构使用移动设备管理，您将会收到通知要求您以无线方式安装它们。此类应用程序属于您的机构，如果您删除配置描述文件或解除 iPhone 与移动设备管理服务器的关系，则它们将被移除或停止工作。